Комбинированное секвенирование геном+экзом расширяет генетические исследования психических расстройств в недопредставленных популяциях

Toni A Boltz · Benjamin B Chu · Matthew DeFelice · Alicia R Martin · Daniel P Howrigan · Benjamin M Neale

Опубликовано 08 Июл 2026

Журнал Nature Genetics

Время чтения 1 мин

Теги

Новый метод BGE (blended genome exome) сочетает низкопокровное полногеномное секвенирование (1-4×) и глубокое экзомное (30-40×) в одном прогоне, обеспечивая до 90% экономии по сравнению с глубоким полногеномным секвенированием. Метод применён к более чем 53 000 образцов проекта PUMAS (Populations Underrepresented in Mental Illness Associations Studies) — африканским, афроамериканским и латиноамериканским популяциям. Импутированные генотипы показали совпадение ≥95% с чипами Illumina Global Screening Array для частых вариантов, а предсказание крупных копийных вариаций (делеций/дупликаций из ≥3 экзонов) — точность около 90% относительно глубокого полногеномного секвенирования.

**Проблема.** Подавляющее большинство генетических исследований психических расстройств проведено на популяциях европейского происхождения, что ограничивает переносимость полигенных оценок риска и генетических открытий на другие этнические группы — критический разрыв в справедливости доступа к психиатрической генетике.

**Метод.** Авторы разработали BGE (blended genome exome) — библиотечный подход, дающий низкопокровный полногеномный (1-4×) и глубокий экзомный (30-40×) профиль в одном прогоне секвенирования. Метод развёрнут на >53 000 образцах проекта PUMAS (Populations Underrepresented in Mental Illness Associations Studies), включая африканские, афроамериканские и латиноамериканские когорты.

**Результаты.** Импутированные по BGE-данным генотипы совпали с чипом Illumina Global Screening Array на ≥95% (частые варианты, MAF≥1%) и ≥90% (редкие варианты, MAF<1%), с устойчивой производительностью по локальным предкам в смешанных когортах. Для копийных вариаций белок-кодирующих участков (делеции/дупликации ≥3 экзонов) положительная предсказательная ценность составила ~90% относительно глубокого полногеномного секвенирования — при стоимости примерно 28% от полного полногеномного секвенирования.

**Значение.** BGE даёт масштабируемую и экономически доступную платформу для расширения генетических открытий в психиатрии на недопредставленные популяции — прямая инфраструктурная предпосылка для будущих исследований биологических механизмов депрессии, шизофрении и других расстройств за пределами выборок европейского происхождения.

**Источник:** DOI: [10.1016/j.tig.2014.11.004](https://doi.org/10.1016/j.tig.2014.11.004), PMID: [42420521](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42420521/)