Уменьшение артефактов фиксации в пространственной транскриптомике: методологические выводы из ткани человеческого мозга

В работе разработан протокол пространственного анализа экспрессии РНК в двух клеточных популяциях (микроглия и CRH-нейроны) из длительно фиксированного формалином гипоталамуса человека. С помощью GeoMx Digital Spatial Profiler и оптимизации условий восстановления РНК удалось получить надежные транскриптомные данные. Выявлено 932 дифференциально экспрессируемых гена между сегментами, что подтверждает пригодность долговременно фиксированной ткани мозга для транскриптомных исследований.

**Выводы:** Разработанный протокол позволяет получать надежные транскриптомные данные из фиксированной ткани мозга, что открывает возможности для ретроспективных исследований психиатрических и неврологических заболеваний. Метод преодолевает ограничения, связанные с низким качеством РНК в архивированных образцах.